Már csak három kör volt hátra az ausztrál futamból, amikor a pályára kellett küldeni a biztonsági autót, és a mezőny Bernd Mayländer mögött is fejezte be a küzdelmet. Ezen időszakban tilos előzni, ám Hamilton megelőzte az aszfaltcsíkról lecsúszó Trullit, aki néhány pillanattal később visszavette harmadik pozícióját.

A pódiumon aztán még Trulli pezsgőzhetett, később azonban 25 másodperces időbüntetést kapott, így a 2008-as világbajnoké lett a harmadik helyezés. A toyotás bokszutca-áthajtásos büntetést kapott volna, ha tart a futam, ezért adtak hozzá idejéhez plusz másodperceket, ez ellen pedig nem lehet fellebbezni. A japán csapat mégis így akart tenni, ám végül beletörődött az ítéletbe.

A mclarenes egyébként azt állította, nem volt más választása, mint megelőzni a toyotást, míg utóbbi, helyezése visszavételekor szintén ugyanezt állította. Hamiltont aztán a futam után több helyen is idézték, amint azt mondja, hogy a csapat szólt rá rádión, hogy engedje el Trullit. Az olasz pedig a verseny után arról számolt be, hogy azt hitte a britnek valami problémája van, emiatt haladt lassan, így neki sem volt más választása, mint hogy visszaelőzze.

Szerdán este pedig kiderült, új bizonyíték jutott a versenybírák birtokába, méghozzá a McLaren és Hamilton közötti rádióbeszélgetés, így Malajziában ismét elővették az ügyet, és a versenybírák Trullit és Hamilton is beidézték csütörtökre, hogy tisztázzák, mi is történt a biztonsági autós periódus alatt. Az autosport.com mindemellett arról is beszámolt, hogy a meghallgatásra az ausztráliai versenybírák is hivatalosak voltak.

Malajziában pedig a McLaren és a Toyota rádióbeszélgetéseinek értékelése, és az érintettek meghallgatása után megszületett a versenybírák új döntése, akik úgy határoztak, hogy Hamiltont kizárják az ausztrál futamból, Trulli Melbourne-ben kapott büntetését pedig törlik. Mindez azt is jelenti, hogy a toyotás számít a harmadik helyezettnek Ausztráliában.

A versenybírák úgy ítélték meg, hogy a rádióbeszélgetéseken elhangzottak ellentmondanak annak, amit Hamilton és a McLaren az ausztrál verseny utáni meghallgatáson elmondott. A versenybírák által kiadott közleményből kiderült, hogy az illetékesek szerint a pilóta és csapat szándékosan félrevezette őket Melbourne-ben, és ezzel az érintettek megsértették a Nemzetközi Sportkódex 151c cikkét: "A Nemzetközi Sportkódex 158-as cikke alapján az egyes rajtszámot viselő Lewis Hamiltont és a McLaren-Mercedest kizárjuk a 2009-es Ausztrál Nagydíjról, és a végeredményt ezzel összhangban módosítjuk."

A 2009-es Forma-1-es Ausztrál Nagydíj módosított végeredménye:

Ausztrál Nagydíj 2009. március 29. vasárnap
Végeredmény
1.		Jenson Button [Brawn GP]	1ó34:15.784	10 pont
2.		Rubens Barrichello [Brawn GP]	+ 0.807	8 pont
3.		Jarno Trulli [Toyota]	+ 1.604	6 pont
4.		Timo Glock [Toyota]	+ 4.435	5 pont
5.		Fernando Alonso [Renault]	+ 4.879	4 pont
6.		Nico Rosberg [Williams]	+ 5.722	3 pont
7.		Sébastien Buemi [Toro Rosso]	+ 6.004	2 pont
8.		Sébastien Bourdais [Toro Rosso]	+ 6.298	1 pont
9.		Adrian Sutil [Force India]	+ 6.335
10.		Nick Heidfeld [BMW Sauber]	+ 7.085
11.		Giancarlo Fisichella [Force India]	+ 7.374
12.		Mark Webber [Red Bull Racing]	+ 1 kör
13.		Sebastian Vettel [Red Bull Racing]	+ 2 kör
14.		Robert Kubica [BMW Sauber]	+ 3 kör
15.		Kimi Räikkönen [Ferrari]	+ 3 kör
16.		Lewis Hamilton [McLaren-Mercedes]	diszkvalifikálták
Leggyorsabb kör
		Nico Rosberg [Williams]	1:27.706 (48.kör)
Kiesők
17.		Felipe Massa [Ferrari]	46. kör
18.		Nakadzsima Kazuki [Williams]	25. kör
19.		Nelsinho Piquet [Renault]	18. kör
20.		Heikki Kovalainen [McLaren-Mercedes]	1. kör